Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX29Q8TEQ0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms