Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

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Length 659 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SSH3Q8TE77 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSH3Q8TE77 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
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