Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF248Q8NDW4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF248Q8NDW4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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ZNF248Q8NDW4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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ZNF248Q8NDW4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF248Q8NDW4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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