Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
VPS8Q8N3P4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
VPS8Q8N3P4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
VPS8Q8N3P4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
VPS8Q8N3P4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
VPS8Q8N3P4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
VPS8Q8N3P4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
VPS8Q8N3P4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
VPS8Q8N3P4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
VPS8Q8N3P4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
VPS8Q8N3P4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
VPS8Q8N3P4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
VPS8Q8N3P4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
VPS8Q8N3P4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
VPS8Q8N3P4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
VPS8Q8N3P4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
VPS8Q8N3P4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
VPS8Q8N3P4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
VPS8Q8N3P4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
VPS8Q8N3P4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
VPS8Q8N3P4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
VPS8Q8N3P4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
VPS8Q8N3P4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
VPS8Q8N3P4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
VPS8Q8N3P4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
VPS8Q8N3P4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
VPS8Q8N3P4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.73
VPS8Q8N3P4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.06■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC32.02■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC32.02■■■□□ 2.72
VPS8Q8N3P4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.2 ms