Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWQ3

BRSK2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK2Q8IWQ3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRSK2Q8IWQ3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRSK2Q8IWQ3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRSK2Q8IWQ3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRSK2Q8IWQ3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRSK2Q8IWQ3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRSK2Q8IWQ3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRSK2Q8IWQ3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRSK2Q8IWQ3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRSK2Q8IWQ3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRSK2Q8IWQ3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRSK2Q8IWQ3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRSK2Q8IWQ3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRSK2Q8IWQ3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRSK2Q8IWQ3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRSK2Q8IWQ3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRSK2Q8IWQ3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRSK2Q8IWQ3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BRSK2Q8IWQ3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRSK2Q8IWQ3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRSK2Q8IWQ3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRSK2Q8IWQ3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms