Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A9Q8IVB4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A9Q8IVB4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms