Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NME9Q86XW9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms