Protein–RNA interactions for Protein: Q6GYQ0

RALGAPA1, Ral GTPase-activating protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 2,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPA1Q6GYQ0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RALGAPA1Q6GYQ0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RALGAPA1Q6GYQ0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RALGAPA1Q6GYQ0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RALGAPA1Q6GYQ0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RALGAPA1Q6GYQ0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RALGAPA1Q6GYQ0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RALGAPA1Q6GYQ0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RALGAPA1Q6GYQ0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RALGAPA1Q6GYQ0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RALGAPA1Q6GYQ0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RALGAPA1Q6GYQ0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RALGAPA1Q6GYQ0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RALGAPA1Q6GYQ0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RALGAPA1Q6GYQ0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RALGAPA1Q6GYQ0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RALGAPA1Q6GYQ0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RALGAPA1Q6GYQ0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RALGAPA1Q6GYQ0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RALGAPA1Q6GYQ0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RALGAPA1Q6GYQ0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RALGAPA1Q6GYQ0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RALGAPA1Q6GYQ0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RALGAPA1Q6GYQ0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RALGAPA1Q6GYQ0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RALGAPA1Q6GYQ0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RALGAPA1Q6GYQ0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RALGAPA1Q6GYQ0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RALGAPA1Q6GYQ0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RALGAPA1Q6GYQ0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RALGAPA1Q6GYQ0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RALGAPA1Q6GYQ0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RALGAPA1Q6GYQ0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RALGAPA1Q6GYQ0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RALGAPA1Q6GYQ0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RALGAPA1Q6GYQ0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RALGAPA1Q6GYQ0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RALGAPA1Q6GYQ0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RALGAPA1Q6GYQ0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RALGAPA1Q6GYQ0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RALGAPA1Q6GYQ0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RALGAPA1Q6GYQ0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RALGAPA1Q6GYQ0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RALGAPA1Q6GYQ0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RALGAPA1Q6GYQ0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RALGAPA1Q6GYQ0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RALGAPA1Q6GYQ0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RALGAPA1Q6GYQ0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
RALGAPA1Q6GYQ0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RALGAPA1Q6GYQ0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RALGAPA1Q6GYQ0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RALGAPA1Q6GYQ0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RALGAPA1Q6GYQ0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RALGAPA1Q6GYQ0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RALGAPA1Q6GYQ0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RALGAPA1Q6GYQ0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RALGAPA1Q6GYQ0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RALGAPA1Q6GYQ0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RALGAPA1Q6GYQ0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RALGAPA1Q6GYQ0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RALGAPA1Q6GYQ0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RALGAPA1Q6GYQ0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RALGAPA1Q6GYQ0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RALGAPA1Q6GYQ0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RALGAPA1Q6GYQ0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RALGAPA1Q6GYQ0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RALGAPA1Q6GYQ0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RALGAPA1Q6GYQ0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RALGAPA1Q6GYQ0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RALGAPA1Q6GYQ0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RALGAPA1Q6GYQ0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RALGAPA1Q6GYQ0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RALGAPA1Q6GYQ0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RALGAPA1Q6GYQ0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RALGAPA1Q6GYQ0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RALGAPA1Q6GYQ0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RALGAPA1Q6GYQ0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RALGAPA1Q6GYQ0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RALGAPA1Q6GYQ0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RALGAPA1Q6GYQ0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RALGAPA1Q6GYQ0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RALGAPA1Q6GYQ0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RALGAPA1Q6GYQ0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RALGAPA1Q6GYQ0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RALGAPA1Q6GYQ0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RALGAPA1Q6GYQ0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RALGAPA1Q6GYQ0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RALGAPA1Q6GYQ0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RALGAPA1Q6GYQ0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RALGAPA1Q6GYQ0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RALGAPA1Q6GYQ0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RALGAPA1Q6GYQ0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms