Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZY7

SCARA3, Scavenger receptor class A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA3Q6AZY7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms