Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX8Q68G74 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX8Q68G74 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms