Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms