Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH8Q5T0T0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms