Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CELF3Q5SZQ8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CELF3Q5SZQ8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CELF3Q5SZQ8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CELF3Q5SZQ8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CELF3Q5SZQ8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CELF3Q5SZQ8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CELF3Q5SZQ8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CELF3Q5SZQ8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CELF3Q5SZQ8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CELF3Q5SZQ8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CELF3Q5SZQ8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CELF3Q5SZQ8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CELF3Q5SZQ8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CELF3Q5SZQ8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CELF3Q5SZQ8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CELF3Q5SZQ8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CELF3Q5SZQ8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CELF3Q5SZQ8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CELF3Q5SZQ8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CELF3Q5SZQ8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CELF3Q5SZQ8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CELF3Q5SZQ8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CELF3Q5SZQ8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CELF3Q5SZQ8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CELF3Q5SZQ8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CELF3Q5SZQ8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CELF3Q5SZQ8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CELF3Q5SZQ8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CELF3Q5SZQ8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms