Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC9

AKAP4, A-kinase anchor protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP4Q5JQC9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AKAP4Q5JQC9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AKAP4Q5JQC9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AKAP4Q5JQC9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
AKAP4Q5JQC9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
AKAP4Q5JQC9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
AKAP4Q5JQC9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
AKAP4Q5JQC9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
AKAP4Q5JQC9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
AKAP4Q5JQC9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
AKAP4Q5JQC9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
AKAP4Q5JQC9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
AKAP4Q5JQC9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
AKAP4Q5JQC9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
AKAP4Q5JQC9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
AKAP4Q5JQC9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AKAP4Q5JQC9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms