Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
R3HDM1Q15032 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
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