Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALCAMQ13740 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
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