Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFIAQ12857 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
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