Protein–RNA interactions for Protein: Q12748

CTF3, Inner kinetochore subunit CTF3, yeastyeast

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTF3Q12748 PSK2YOL045W 3306 nt2.47□□□□□ -2.01
CTF3Q12748 UTP13YLR222C 2454 nt2.47□□□□□ -2.01
CTF3Q12748 YDR239CYDR239C 2364 nt2.46□□□□□ -2.01
CTF3Q12748 SWA2YDR320C 2007 nt2.46□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 HOS4YIL112W 3252 nt2.46□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 YER006C-AYER006C-A 318 nt2.46□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 RAD6YGL058W 519 nt2.46□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 RMP1YLR145W 606 nt2.46□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 YPL039WYPL039W 951 nt2.46□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 PSO2YMR137C 1986 nt2.46□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 ORC2YBR060C 1863 nt2.45□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 TOR1YJR066W 7413 nt2.45□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 YNL018CYNL018C 1839 nt2.45□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 TRS130YMR218C 3309 nt2.45□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 IES5YER092W 378 nt2.45□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 RPL29YFR032C-A 180 nt2.45□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 YPS5YGL259W 498 nt2.45□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 NFU1YKL040C 771 nt2.45□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 YLR269CYLR269C 351 nt2.45□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 NSL1YPL233W 651 nt2.45□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 PRP6YBR055C 2700 nt2.45□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 SCD5YOR329C 2619 nt2.44□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 INP53YOR109W 3324 nt2.44□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 HSC82YMR186W 2118 nt2.44□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 YDR209CYDR209C 414 nt2.44□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 RNR4YGR180C 1038 nt2.44□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 CMC2YBL059C-A 330 nt2.44□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 YPL080CYPL080C 327 nt2.44□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 ACM1YPL267W 630 nt2.44□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 MSS18YPR134W 807 nt2.44□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 ESC1YMR219W 4977 nt2.43□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 UBP1YDL122W 2430 nt2.43□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 ECM25YJL201W 1800 nt2.43□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 YPR089WYPR089W 2667 nt2.43□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 ACB1YGR037C 264 nt2.43□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt2.43□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 ICY1YMR195W 384 nt2.43□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 YBR197CYBR197C 654 nt2.43□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 SIR3YLR442C 2937 nt2.43□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 SDC1YDR469W 528 nt2.42□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 YER135CYER135C 393 nt2.42□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt2.42□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 AIM32YML050W 936 nt2.42□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 TRM7YBR061C 933 nt2.42□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 YNL034WYNL034W 1839 nt2.42□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 CBF2YGR140W 2871 nt2.42□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt2.42□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 ROY1YMR258C 1662 nt2.41□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 SGM1YJR134C 2124 nt2.41□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 YDR269CYDR269C 324 nt2.41□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt2.41□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 NBL1YHR199C-A 222 nt2.41□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 SWM2YNR004W 441 nt2.41□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 NUP170YBL079W 4509 nt2.41□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 YEL043WYEL043W 2871 nt2.4□□□□□ -2.02
CTF3Q12748 KSP1YHR082C 3090 nt2.4□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 TSA2YDR453C 591 nt2.4□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 IRC4YDR540C 540 nt2.4□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 YER079WYER079W 633 nt2.4□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 TWF1YGR080W 999 nt2.4□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 YJR023CYJR023C 402 nt2.4□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 KTI11YBL071W-A 249 nt2.4□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 YOL159CYOL159C 516 nt2.4□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt2.4□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 YPL197CYPL197C 414 nt2.4□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt2.4□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt2.4□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt2.4□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 SAP190YKR028W 3102 nt2.39□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 CBS1YDL069C 690 nt2.39□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 YER087C-AYER087C-A 552 nt2.39□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 YJR079WYJR079W 330 nt2.39□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.39□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 RPL37AYLR185W 267 nt2.39□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 CDC33YOL139C 642 nt2.39□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 VPS16YPL045W 2397 nt2.39□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 NUP100YKL068W 2880 nt2.39□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 DPB11YJL090C 2295 nt2.38□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 RPS24AYER074W 408 nt2.38□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 CRG1YHR209W 876 nt2.38□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 ATP7YKL016C 525 nt2.38□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 YML084WYML084W 309 nt2.38□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 YOR248WYOR248W 303 nt2.38□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 YBR032WYBR032W 303 nt2.38□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 ECM5YMR176W 4236 nt2.38□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 SSE1YPL106C 2082 nt2.37□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 YHR138CYHR138C 345 nt2.37□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 SIP18YMR175W 240 nt2.37□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 YMR320WYMR320W 306 nt2.37□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 DGK1YOR311C 873 nt2.37□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 ATG11YPR049C 3537 nt2.37□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 LEU3YLR451W 2661 nt2.37□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 PES4YFR023W 1836 nt2.37□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 ASG1YIL130W 2895 nt2.37□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 RNH70YGR276C 1662 nt2.37□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 PRK1YIL095W 2433 nt2.37□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 SNU114YKL173W 3027 nt2.36□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 SVL3YPL032C 2478 nt2.36□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 SAK1YER129W 3429 nt2.36□□□□□ -2.03
CTF3Q12748 SSQ1YLR369W 1974 nt2.36□□□□□ -2.03
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