Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CPSF1Q10570 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CPSF1Q10570 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
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