Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NIPAL4Q0D2K0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms