Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms