Protein–RNA interactions for Protein: Q08490

SGO1, Shugoshin, yeastyeast

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Length 590 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SGO1Q08490 YMR31YFR049W 372 nt3.07□□□□□ -1.92
SGO1Q08490 YJL015CYJL015C 285 nt3.07□□□□□ -1.92
SGO1Q08490 TIM8YJR135W-A 264 nt3.07□□□□□ -1.92
SGO1Q08490 YBL073WYBL073W 312 nt3.07□□□□□ -1.92
SGO1Q08490 YHR080CYHR080C 4038 nt3.07□□□□□ -1.92
SGO1Q08490 YHR078WYHR078W 1659 nt3.07□□□□□ -1.92
SGO1Q08490 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt3.06□□□□□ -1.92
SGO1Q08490 ROG1YGL144C 2058 nt3.06□□□□□ -1.92
SGO1Q08490 MDV1YJL112W 2145 nt3.06□□□□□ -1.92
SGO1Q08490 LCL2YLR104W 396 nt3.06□□□□□ -1.92
SGO1Q08490 RPL20BYOR312C 519 nt3.06□□□□□ -1.92
SGO1Q08490 YPL229WYPL229W 621 nt3.06□□□□□ -1.92
SGO1Q08490 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt3.05□□□□□ -1.92
SGO1Q08490 ECM21YBL101C 3354 nt3.05□□□□□ -1.92
SGO1Q08490 SNQ2YDR011W 4506 nt3.05□□□□□ -1.92
SGO1Q08490 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt3.05□□□□□ -1.92
SGO1Q08490 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt3.05□□□□□ -1.92
SGO1Q08490 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt3.05□□□□□ -1.92
SGO1Q08490 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt3.05□□□□□ -1.92
SGO1Q08490 YLR294CYLR294C 330 nt3.05□□□□□ -1.92
SGO1Q08490 CCW14YLR390W-A 717 nt3.05□□□□□ -1.92
SGO1Q08490 CHS2YBR038W 2892 nt3.05□□□□□ -1.92
SGO1Q08490 YNL034WYNL034W 1839 nt3.05□□□□□ -1.92
SGO1Q08490 GYP7YDL234C 2241 nt3.04□□□□□ -1.92
SGO1Q08490 POM152YMR129W 4014 nt3.04□□□□□ -1.92
SGO1Q08490 TLC1TLC1 1301 nt3.04□□□□□ -1.92
SGO1Q08490 snR70snR70 164 nt3.04□□□□□ -1.92
SGO1Q08490 snR80snR80 171 nt3.04□□□□□ -1.92
SGO1Q08490 CYC7YEL039C 342 nt3.04□□□□□ -1.92
SGO1Q08490 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt3.04□□□□□ -1.92
SGO1Q08490 YIL058WYIL058W 285 nt3.04□□□□□ -1.92
SGO1Q08490 RPL26AYLR344W 384 nt3.04□□□□□ -1.92
SGO1Q08490 RPL9BYNL067W 576 nt3.04□□□□□ -1.92
SGO1Q08490 COX1Q0045 1605 nt3.04□□□□□ -1.92
SGO1Q08490 SIP3YNL257C 3690 nt3.04□□□□□ -1.92
SGO1Q08490 PCF11YDR228C 1881 nt3.03□□□□□ -1.92
SGO1Q08490 YNL198CYNL198C 303 nt3.03□□□□□ -1.92
SGO1Q08490 RPL36BYPL249C-A 303 nt3.03□□□□□ -1.92
SGO1Q08490 UBP14YBR058C 2346 nt3.03□□□□□ -1.92
SGO1Q08490 TOM70YNL121C 1854 nt3.03□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 RAX2YLR084C 3663 nt3.02□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 RPS17BYDR447C 411 nt3.02□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 YER023C-AYER023C-A 213 nt3.02□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 PSY1YKL076C 384 nt3.02□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 ESF2YNR054C 951 nt3.02□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt3.02□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 NUP120YKL057C 3114 nt3.02□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 NPR3YHL023C 3441 nt3.02□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 CIN8YEL061C 3003 nt3.01□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 NPR1YNL183C 2373 nt3.01□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 BLI1YKL061W 342 nt3.01□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 COX7YMR256C 183 nt3.01□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 COG3YER157W 2406 nt3.01□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 TSC11YER093C 4293 nt3.01□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 YAT2YER024W 2772 nt3□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 VPS64YDR200C 1815 nt3□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 LYS9YNR050C 1341 nt3□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 CHO2YGR157W 2610 nt3□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt3□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 YGR265WYGR265W 411 nt3□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 NCE101YJL205C 162 nt3□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 ATP15YPL271W 189 nt3□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 YPR099CYPR099C 357 nt3□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 FUN30YAL019W 3396 nt3□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 BOI1YBL085W 2943 nt3□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 BUD4YJR092W 4344 nt3□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 SSY1YDR160W 2559 nt3□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 DNA2YHR164C 4569 nt2.99□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.99□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.99□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.99□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.99□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.99□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 YCL019WYCL019W 5313 nt2.99□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 snR51snR51 107 nt2.99□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 TPS2YDR074W 2691 nt2.99□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 SRB8YCR081W 4284 nt2.99□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 ECM5YMR176W 4236 nt2.99□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 ATG13YPR185W 2217 nt2.99□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 FUS1YCL027W 1539 nt2.98□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 YOL057WYOL057W 2136 nt2.98□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 IRC10YOL015W 1761 nt2.98□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 WIP1YDR374W-A 270 nt2.98□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 EXO84YBR102C 2262 nt2.98□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt2.97□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 HYR1YIR037W 492 nt2.97□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 ECM25YJL201W 1800 nt2.97□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 DBP7YKR024C 2229 nt2.97□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 RKM1YPL208W 1752 nt2.97□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 GCD6YDR211W 2139 nt2.96□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 NUP82YJL061W 2142 nt2.96□□□□□ -1.93
SGO1Q08490 RLF2YPR018W 1821 nt2.96□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 YJL016WYJL016W 1686 nt2.96□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 ADK1YDR226W 669 nt2.96□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.96□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 YOR050CYOR050C 348 nt2.96□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 YIL166CYIL166C 1629 nt2.96□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 BNA4YBL098W 1383 nt2.96□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 HEH2YDR458C 1992 nt2.96□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 APC2YLR127C 2562 nt2.96□□□□□ -1.94
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