Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DHX9Q08211 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms