Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CD164Q04900 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CD164Q04900 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CD164Q04900 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CD164Q04900 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CD164Q04900 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CD164Q04900 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CD164Q04900 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CD164Q04900 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CD164Q04900 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CD164Q04900 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CD164Q04900 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CD164Q04900 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CD164Q04900 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CD164Q04900 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CD164Q04900 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CD164Q04900 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CD164Q04900 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CD164Q04900 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CD164Q04900 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CD164Q04900 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CD164Q04900 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CD164Q04900 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CD164Q04900 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CD164Q04900 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CD164Q04900 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CD164Q04900 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CD164Q04900 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CD164Q04900 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CD164Q04900 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CD164Q04900 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CD164Q04900 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CD164Q04900 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CD164Q04900 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CD164Q04900 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
CD164Q04900 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CD164Q04900 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CD164Q04900 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CD164Q04900 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CD164Q04900 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CD164Q04900 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CD164Q04900 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
CD164Q04900 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CD164Q04900 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CD164Q04900 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CD164Q04900 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CD164Q04900 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CD164Q04900 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CD164Q04900 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
CD164Q04900 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
CD164Q04900 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
CD164Q04900 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CD164Q04900 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CD164Q04900 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CD164Q04900 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
CD164Q04900 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CD164Q04900 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CD164Q04900 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CD164Q04900 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CD164Q04900 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CD164Q04900 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD164Q04900 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD164Q04900 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD164Q04900 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD164Q04900 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD164Q04900 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
CD164Q04900 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD164Q04900 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD164Q04900 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD164Q04900 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD164Q04900 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD164Q04900 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD164Q04900 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD164Q04900 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD164Q04900 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD164Q04900 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD164Q04900 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD164Q04900 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD164Q04900 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD164Q04900 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD164Q04900 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
CD164Q04900 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CD164Q04900 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD164Q04900 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD164Q04900 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD164Q04900 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD164Q04900 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD164Q04900 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD164Q04900 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD164Q04900 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD164Q04900 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD164Q04900 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD164Q04900 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD164Q04900 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD164Q04900 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD164Q04900 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD164Q04900 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD164Q04900 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD164Q04900 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD164Q04900 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms