Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRF9Q00978 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms