Protein–RNA interactions for Protein: P55899

FCGRT, IgG receptor FcRn large subunit p51, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCGRTP55899 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FCGRTP55899 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FCGRTP55899 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FCGRTP55899 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FCGRTP55899 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FCGRTP55899 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FCGRTP55899 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms