Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUMO3P55854 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms