Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITPNBP48739 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms