Protein–RNA interactions for Protein: P38935

IGHMBP2, DNA-binding protein SMUBP-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHMBP2P38935 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IGHMBP2P38935 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms