Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms