Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJB2P29033 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJB2P29033 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJB2P29033 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJB2P29033 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GJB2P29033 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJB2P29033 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJB2P29033 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GJB2P29033 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJB2P29033 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJB2P29033 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJB2P29033 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GJB2P29033 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GJB2P29033 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
GJB2P29033 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB2P29033 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB2P29033 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB2P29033 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB2P29033 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB2P29033 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB2P29033 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB2P29033 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB2P29033 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB2P29033 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB2P29033 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB2P29033 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB2P29033 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB2P29033 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB2P29033 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB2P29033 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB2P29033 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB2P29033 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB2P29033 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB2P29033 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB2P29033 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB2P29033 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB2P29033 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB2P29033 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB2P29033 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB2P29033 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB2P29033 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB2P29033 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB2P29033 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB2P29033 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB2P29033 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB2P29033 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB2P29033 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB2P29033 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB2P29033 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB2P29033 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB2P29033 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB2P29033 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB2P29033 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB2P29033 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB2P29033 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB2P29033 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB2P29033 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB2P29033 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB2P29033 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB2P29033 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB2P29033 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB2P29033 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB2P29033 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB2P29033 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB2P29033 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB2P29033 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB2P29033 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB2P29033 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB2P29033 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB2P29033 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB2P29033 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB2P29033 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB2P29033 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB2P29033 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB2P29033 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB2P29033 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB2P29033 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB2P29033 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB2P29033 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB2P29033 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB2P29033 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB2P29033 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB2P29033 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB2P29033 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB2P29033 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB2P29033 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB2P29033 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB2P29033 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB2P29033 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB2P29033 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB2P29033 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB2P29033 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB2P29033 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB2P29033 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB2P29033 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB2P29033 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJB2P29033 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJB2P29033 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJB2P29033 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJB2P29033 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms