Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMB5P28074 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMB5P28074 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMB5P28074 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMB5P28074 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMB5P28074 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMB5P28074 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMB5P28074 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMB5P28074 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMB5P28074 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMB5P28074 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB5P28074 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms