Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms