Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRGP23470 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms