Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL17P18621 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL17P18621 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL17P18621 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL17P18621 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL17P18621 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL17P18621 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL17P18621 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL17P18621 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL17P18621 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL17P18621 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL17P18621 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL17P18621 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL17P18621 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL17P18621 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL17P18621 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL17P18621 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL17P18621 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL17P18621 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL17P18621 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL17P18621 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL17P18621 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL17P18621 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL17P18621 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL17P18621 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL17P18621 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL17P18621 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL17P18621 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL17P18621 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL17P18621 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL17P18621 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL17P18621 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL17P18621 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL17P18621 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL17P18621 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL17P18621 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL17P18621 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL17P18621 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL17P18621 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL17P18621 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL17P18621 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL17P18621 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL17P18621 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL17P18621 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL17P18621 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL17P18621 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL17P18621 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL17P18621 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL17P18621 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL17P18621 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL17P18621 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL17P18621 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL17P18621 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL17P18621 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL17P18621 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL17P18621 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL17P18621 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL17P18621 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL17P18621 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL17P18621 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL17P18621 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL17P18621 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL17P18621 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL17P18621 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL17P18621 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL17P18621 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL17P18621 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL17P18621 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL17P18621 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL17P18621 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL17P18621 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL17P18621 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL17P18621 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL17P18621 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL17P18621 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL17P18621 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL17P18621 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL17P18621 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL17P18621 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL17P18621 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL17P18621 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL17P18621 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL17P18621 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL17P18621 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL17P18621 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL17P18621 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL17P18621 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL17P18621 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL17P18621 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL17P18621 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL17P18621 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL17P18621 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL17P18621 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL17P18621 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL17P18621 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL17P18621 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL17P18621 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL17P18621 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL17P18621 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL17P18621 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms