Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB4P17483 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms