Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA1P17302 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GJA1P17302 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJA1P17302 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJA1P17302 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJA1P17302 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GJA1P17302 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GJA1P17302 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJA1P17302 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GJA1P17302 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GJA1P17302 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GJA1P17302 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GJA1P17302 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA1P17302 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA1P17302 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA1P17302 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA1P17302 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA1P17302 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA1P17302 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA1P17302 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA1P17302 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA1P17302 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA1P17302 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA1P17302 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA1P17302 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA1P17302 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA1P17302 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA1P17302 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA1P17302 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA1P17302 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA1P17302 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA1P17302 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA1P17302 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA1P17302 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA1P17302 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA1P17302 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA1P17302 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA1P17302 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA1P17302 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA1P17302 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA1P17302 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA1P17302 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA1P17302 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA1P17302 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA1P17302 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA1P17302 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA1P17302 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA1P17302 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA1P17302 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA1P17302 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA1P17302 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA1P17302 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA1P17302 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA1P17302 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA1P17302 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA1P17302 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA1P17302 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA1P17302 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA1P17302 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA1P17302 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA1P17302 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA1P17302 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA1P17302 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA1P17302 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA1P17302 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA1P17302 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA1P17302 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA1P17302 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA1P17302 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA1P17302 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA1P17302 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA1P17302 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA1P17302 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA1P17302 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA1P17302 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA1P17302 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA1P17302 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA1P17302 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA1P17302 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA1P17302 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA1P17302 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA1P17302 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA1P17302 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA1P17302 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA1P17302 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA1P17302 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA1P17302 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA1P17302 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA1P17302 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA1P17302 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA1P17302 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA1P17302 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA1P17302 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA1P17302 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA1P17302 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA1P17302 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA1P17302 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA1P17302 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA1P17302 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA1P17302 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms