Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABRA1P14867 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms