Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN1P12814 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms