Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C8orf88P0DMB2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms