Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3O43889 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3O43889 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3O43889 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3O43889 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB3O43889 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB3O43889 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB3O43889 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB3O43889 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB3O43889 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB3O43889 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB3O43889 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB3O43889 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB3O43889 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB3O43889 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB3O43889 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB3O43889 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB3O43889 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB3O43889 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB3O43889 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB3O43889 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB3O43889 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB3O43889 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB3O43889 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB3O43889 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB3O43889 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB3O43889 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB3O43889 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB3O43889 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB3O43889 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB3O43889 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB3O43889 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB3O43889 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB3O43889 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB3O43889 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB3O43889 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB3O43889 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB3O43889 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB3O43889 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB3O43889 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB3O43889 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB3O43889 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB3O43889 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB3O43889 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB3O43889 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB3O43889 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB3O43889 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB3O43889 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB3O43889 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB3O43889 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB3O43889 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB3O43889 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB3O43889 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB3O43889 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB3O43889 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB3O43889 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB3O43889 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB3O43889 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB3O43889 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB3O43889 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB3O43889 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB3O43889 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB3O43889 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB3O43889 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB3O43889 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB3O43889 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB3O43889 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB3O43889 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB3O43889 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB3O43889 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB3O43889 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB3O43889 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB3O43889 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CREB3O43889 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CREB3O43889 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CREB3O43889 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CREB3O43889 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CREB3O43889 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CREB3O43889 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CREB3O43889 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CREB3O43889 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CREB3O43889 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CREB3O43889 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CREB3O43889 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CREB3O43889 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CREB3O43889 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CREB3O43889 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CREB3O43889 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CREB3O43889 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CREB3O43889 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CREB3O43889 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CREB3O43889 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CREB3O43889 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CREB3O43889 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CREB3O43889 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CREB3O43889 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CREB3O43889 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CREB3O43889 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CREB3O43889 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CREB3O43889 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms