Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRGAP3O43295 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms