Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLXNB1O43157 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms