Protein–RNA interactions for Protein: O00295

TULP2, Tubby-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP2O00295 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TULP2O00295 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TULP2O00295 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TULP2O00295 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TULP2O00295 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TULP2O00295 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TULP2O00295 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TULP2O00295 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TULP2O00295 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TULP2O00295 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP2O00295 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP2O00295 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP2O00295 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP2O00295 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP2O00295 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP2O00295 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP2O00295 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP2O00295 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP2O00295 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP2O00295 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP2O00295 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP2O00295 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP2O00295 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP2O00295 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP2O00295 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP2O00295 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP2O00295 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP2O00295 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP2O00295 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP2O00295 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP2O00295 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TULP2O00295 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TULP2O00295 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TULP2O00295 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TULP2O00295 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TULP2O00295 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TULP2O00295 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TULP2O00295 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TULP2O00295 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TULP2O00295 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TULP2O00295 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TULP2O00295 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TULP2O00295 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TULP2O00295 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TULP2O00295 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TULP2O00295 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TULP2O00295 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TULP2O00295 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TULP2O00295 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TULP2O00295 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TULP2O00295 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TULP2O00295 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TULP2O00295 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TULP2O00295 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TULP2O00295 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TULP2O00295 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TULP2O00295 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TULP2O00295 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TULP2O00295 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TULP2O00295 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TULP2O00295 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TULP2O00295 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TULP2O00295 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TULP2O00295 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TULP2O00295 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TULP2O00295 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TULP2O00295 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TULP2O00295 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TULP2O00295 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TULP2O00295 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TULP2O00295 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TULP2O00295 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TULP2O00295 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TULP2O00295 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TULP2O00295 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TULP2O00295 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TULP2O00295 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TULP2O00295 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TULP2O00295 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TULP2O00295 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TULP2O00295 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TULP2O00295 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TULP2O00295 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TULP2O00295 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TULP2O00295 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TULP2O00295 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TULP2O00295 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TULP2O00295 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TULP2O00295 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TULP2O00295 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TULP2O00295 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TULP2O00295 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TULP2O00295 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TULP2O00295 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TULP2O00295 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TULP2O00295 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TULP2O00295 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TULP2O00295 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TULP2O00295 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TULP2O00295 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms