Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm17190V9GX38 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm17190V9GX38 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm17190V9GX38 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm17190V9GX38 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm17190V9GX38 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm17190V9GX38 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm17190V9GX38 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm17190V9GX38 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm17190V9GX38 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm17190V9GX38 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm17190V9GX38 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm17190V9GX38 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm17190V9GX38 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm17190V9GX38 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm17190V9GX38 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm17190V9GX38 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm17190V9GX38 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm17190V9GX38 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm17190V9GX38 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm17190V9GX38 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm17190V9GX38 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm17190V9GX38 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm17190V9GX38 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm17190V9GX38 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm17190V9GX38 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm17190V9GX38 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm17190V9GX38 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm17190V9GX38 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm17190V9GX38 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm17190V9GX38 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm17190V9GX38 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm17190V9GX38 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm17190V9GX38 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm17190V9GX38 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm17190V9GX38 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm17190V9GX38 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm17190V9GX38 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm17190V9GX38 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm17190V9GX38 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm17190V9GX38 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm17190V9GX38 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm17190V9GX38 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm17190V9GX38 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm17190V9GX38 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm17190V9GX38 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm17190V9GX38 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm17190V9GX38 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm17190V9GX38 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm17190V9GX38 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm17190V9GX38 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm17190V9GX38 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm17190V9GX38 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm17190V9GX38 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm17190V9GX38 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm17190V9GX38 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm17190V9GX38 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm17190V9GX38 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm17190V9GX38 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm17190V9GX38 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm17190V9GX38 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm17190V9GX38 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm17190V9GX38 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm17190V9GX38 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm17190V9GX38 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm17190V9GX38 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm17190V9GX38 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm17190V9GX38 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm17190V9GX38 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm17190V9GX38 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm17190V9GX38 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm17190V9GX38 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm17190V9GX38 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm17190V9GX38 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm17190V9GX38 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm17190V9GX38 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm17190V9GX38 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm17190V9GX38 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm17190V9GX38 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm17190V9GX38 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm17190V9GX38 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm17190V9GX38 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm17190V9GX38 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm17190V9GX38 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm17190V9GX38 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm17190V9GX38 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm17190V9GX38 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm17190V9GX38 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm17190V9GX38 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm17190V9GX38 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm17190V9GX38 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm17190V9GX38 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm17190V9GX38 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm17190V9GX38 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm17190V9GX38 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm17190V9GX38 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm17190V9GX38 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm17190V9GX38 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm17190V9GX38 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm17190V9GX38 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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