Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C8

Ybx2, Y-box-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx2Q9Z2C8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ybx2Q9Z2C8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ybx2Q9Z2C8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ybx2Q9Z2C8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ybx2Q9Z2C8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ybx2Q9Z2C8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ybx2Q9Z2C8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ybx2Q9Z2C8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ybx2Q9Z2C8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ybx2Q9Z2C8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ybx2Q9Z2C8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ybx2Q9Z2C8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ybx2Q9Z2C8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ybx2Q9Z2C8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ybx2Q9Z2C8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ybx2Q9Z2C8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ybx2Q9Z2C8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ybx2Q9Z2C8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ybx2Q9Z2C8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ybx2Q9Z2C8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ybx2Q9Z2C8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ybx2Q9Z2C8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ybx2Q9Z2C8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ybx2Q9Z2C8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ybx2Q9Z2C8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ybx2Q9Z2C8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ybx2Q9Z2C8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ybx2Q9Z2C8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ybx2Q9Z2C8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ybx2Q9Z2C8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ybx2Q9Z2C8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ybx2Q9Z2C8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ybx2Q9Z2C8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ybx2Q9Z2C8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ybx2Q9Z2C8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ybx2Q9Z2C8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ybx2Q9Z2C8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ybx2Q9Z2C8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ybx2Q9Z2C8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ybx2Q9Z2C8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ybx2Q9Z2C8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ybx2Q9Z2C8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ybx2Q9Z2C8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ybx2Q9Z2C8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ybx2Q9Z2C8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ybx2Q9Z2C8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ybx2Q9Z2C8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ybx2Q9Z2C8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ybx2Q9Z2C8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ybx2Q9Z2C8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ybx2Q9Z2C8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ybx2Q9Z2C8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ybx2Q9Z2C8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ybx2Q9Z2C8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ybx2Q9Z2C8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ybx2Q9Z2C8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ybx2Q9Z2C8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ybx2Q9Z2C8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ybx2Q9Z2C8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ybx2Q9Z2C8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ybx2Q9Z2C8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ybx2Q9Z2C8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ybx2Q9Z2C8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ybx2Q9Z2C8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ybx2Q9Z2C8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ybx2Q9Z2C8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ybx2Q9Z2C8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ybx2Q9Z2C8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ybx2Q9Z2C8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ybx2Q9Z2C8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ybx2Q9Z2C8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ybx2Q9Z2C8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ybx2Q9Z2C8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ybx2Q9Z2C8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ybx2Q9Z2C8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ybx2Q9Z2C8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ybx2Q9Z2C8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ybx2Q9Z2C8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ybx2Q9Z2C8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ybx2Q9Z2C8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ybx2Q9Z2C8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ybx2Q9Z2C8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ybx2Q9Z2C8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ybx2Q9Z2C8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ybx2Q9Z2C8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ybx2Q9Z2C8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ybx2Q9Z2C8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ybx2Q9Z2C8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ybx2Q9Z2C8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ybx2Q9Z2C8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ybx2Q9Z2C8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ybx2Q9Z2C8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ybx2Q9Z2C8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ybx2Q9Z2C8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ybx2Q9Z2C8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ybx2Q9Z2C8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ybx2Q9Z2C8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ybx2Q9Z2C8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ybx2Q9Z2C8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ybx2Q9Z2C8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms