Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1B8

Phf1, PHD finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf1Q9Z1B8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Phf1Q9Z1B8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phf1Q9Z1B8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phf1Q9Z1B8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phf1Q9Z1B8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phf1Q9Z1B8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phf1Q9Z1B8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phf1Q9Z1B8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phf1Q9Z1B8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phf1Q9Z1B8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Phf1Q9Z1B8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phf1Q9Z1B8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phf1Q9Z1B8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phf1Q9Z1B8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phf1Q9Z1B8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phf1Q9Z1B8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phf1Q9Z1B8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phf1Q9Z1B8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phf1Q9Z1B8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phf1Q9Z1B8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phf1Q9Z1B8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phf1Q9Z1B8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phf1Q9Z1B8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phf1Q9Z1B8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phf1Q9Z1B8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phf1Q9Z1B8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phf1Q9Z1B8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phf1Q9Z1B8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phf1Q9Z1B8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Phf1Q9Z1B8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phf1Q9Z1B8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phf1Q9Z1B8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phf1Q9Z1B8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phf1Q9Z1B8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phf1Q9Z1B8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phf1Q9Z1B8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phf1Q9Z1B8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phf1Q9Z1B8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Phf1Q9Z1B8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phf1Q9Z1B8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phf1Q9Z1B8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phf1Q9Z1B8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Phf1Q9Z1B8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phf1Q9Z1B8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phf1Q9Z1B8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phf1Q9Z1B8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Phf1Q9Z1B8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phf1Q9Z1B8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phf1Q9Z1B8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phf1Q9Z1B8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phf1Q9Z1B8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phf1Q9Z1B8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phf1Q9Z1B8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phf1Q9Z1B8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phf1Q9Z1B8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phf1Q9Z1B8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phf1Q9Z1B8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phf1Q9Z1B8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phf1Q9Z1B8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phf1Q9Z1B8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phf1Q9Z1B8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phf1Q9Z1B8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phf1Q9Z1B8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phf1Q9Z1B8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phf1Q9Z1B8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phf1Q9Z1B8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phf1Q9Z1B8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phf1Q9Z1B8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phf1Q9Z1B8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phf1Q9Z1B8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phf1Q9Z1B8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phf1Q9Z1B8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phf1Q9Z1B8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phf1Q9Z1B8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Phf1Q9Z1B8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phf1Q9Z1B8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phf1Q9Z1B8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phf1Q9Z1B8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phf1Q9Z1B8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phf1Q9Z1B8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phf1Q9Z1B8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Phf1Q9Z1B8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Phf1Q9Z1B8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phf1Q9Z1B8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phf1Q9Z1B8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phf1Q9Z1B8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Phf1Q9Z1B8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phf1Q9Z1B8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phf1Q9Z1B8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phf1Q9Z1B8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phf1Q9Z1B8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Phf1Q9Z1B8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Phf1Q9Z1B8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Phf1Q9Z1B8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Phf1Q9Z1B8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Phf1Q9Z1B8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Phf1Q9Z1B8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Phf1Q9Z1B8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Phf1Q9Z1B8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Phf1Q9Z1B8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms