Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ArcQ9WV31 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ArcQ9WV31 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ArcQ9WV31 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ArcQ9WV31 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ArcQ9WV31 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ArcQ9WV31 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ArcQ9WV31 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ArcQ9WV31 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ArcQ9WV31 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ArcQ9WV31 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ArcQ9WV31 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ArcQ9WV31 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ArcQ9WV31 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ArcQ9WV31 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ArcQ9WV31 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ArcQ9WV31 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ArcQ9WV31 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ArcQ9WV31 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ArcQ9WV31 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ArcQ9WV31 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ArcQ9WV31 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ArcQ9WV31 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ArcQ9WV31 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ArcQ9WV31 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ArcQ9WV31 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ArcQ9WV31 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ArcQ9WV31 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ArcQ9WV31 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ArcQ9WV31 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ArcQ9WV31 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ArcQ9WV31 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ArcQ9WV31 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ArcQ9WV31 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ArcQ9WV31 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ArcQ9WV31 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ArcQ9WV31 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ArcQ9WV31 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ArcQ9WV31 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ArcQ9WV31 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ArcQ9WV31 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ArcQ9WV31 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ArcQ9WV31 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ArcQ9WV31 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ArcQ9WV31 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ArcQ9WV31 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ArcQ9WV31 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ArcQ9WV31 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ArcQ9WV31 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ArcQ9WV31 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ArcQ9WV31 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ArcQ9WV31 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ArcQ9WV31 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ArcQ9WV31 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ArcQ9WV31 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ArcQ9WV31 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ArcQ9WV31 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ArcQ9WV31 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ArcQ9WV31 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ArcQ9WV31 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ArcQ9WV31 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ArcQ9WV31 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ArcQ9WV31 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ArcQ9WV31 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ArcQ9WV31 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ArcQ9WV31 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ArcQ9WV31 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ArcQ9WV31 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ArcQ9WV31 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ArcQ9WV31 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ArcQ9WV31 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ArcQ9WV31 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ArcQ9WV31 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ArcQ9WV31 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ArcQ9WV31 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ArcQ9WV31 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ArcQ9WV31 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ArcQ9WV31 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ArcQ9WV31 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ArcQ9WV31 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ArcQ9WV31 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ArcQ9WV31 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ArcQ9WV31 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ArcQ9WV31 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ArcQ9WV31 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ArcQ9WV31 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ArcQ9WV31 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ArcQ9WV31 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ArcQ9WV31 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ArcQ9WV31 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ArcQ9WV31 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ArcQ9WV31 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ArcQ9WV31 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ArcQ9WV31 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ArcQ9WV31 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ArcQ9WV31 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ArcQ9WV31 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ArcQ9WV31 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ArcQ9WV31 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ArcQ9WV31 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms