Protein–RNA interactions for Protein: Q9R207

Nbn, Nibrin, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NbnQ9R207 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NbnQ9R207 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NbnQ9R207 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NbnQ9R207 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NbnQ9R207 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NbnQ9R207 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NbnQ9R207 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NbnQ9R207 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NbnQ9R207 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
NbnQ9R207 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NbnQ9R207 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NbnQ9R207 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NbnQ9R207 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NbnQ9R207 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NbnQ9R207 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NbnQ9R207 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NbnQ9R207 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NbnQ9R207 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NbnQ9R207 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NbnQ9R207 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NbnQ9R207 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NbnQ9R207 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NbnQ9R207 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NbnQ9R207 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NbnQ9R207 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NbnQ9R207 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NbnQ9R207 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NbnQ9R207 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NbnQ9R207 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NbnQ9R207 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NbnQ9R207 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NbnQ9R207 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NbnQ9R207 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NbnQ9R207 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NbnQ9R207 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NbnQ9R207 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NbnQ9R207 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NbnQ9R207 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NbnQ9R207 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NbnQ9R207 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NbnQ9R207 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NbnQ9R207 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NbnQ9R207 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NbnQ9R207 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NbnQ9R207 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NbnQ9R207 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NbnQ9R207 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NbnQ9R207 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NbnQ9R207 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NbnQ9R207 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NbnQ9R207 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NbnQ9R207 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NbnQ9R207 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NbnQ9R207 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NbnQ9R207 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NbnQ9R207 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NbnQ9R207 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NbnQ9R207 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NbnQ9R207 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NbnQ9R207 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NbnQ9R207 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NbnQ9R207 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NbnQ9R207 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NbnQ9R207 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NbnQ9R207 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NbnQ9R207 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NbnQ9R207 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NbnQ9R207 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NbnQ9R207 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NbnQ9R207 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NbnQ9R207 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NbnQ9R207 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NbnQ9R207 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NbnQ9R207 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NbnQ9R207 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NbnQ9R207 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NbnQ9R207 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NbnQ9R207 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NbnQ9R207 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NbnQ9R207 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NbnQ9R207 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NbnQ9R207 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NbnQ9R207 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NbnQ9R207 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NbnQ9R207 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NbnQ9R207 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NbnQ9R207 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NbnQ9R207 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NbnQ9R207 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NbnQ9R207 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NbnQ9R207 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NbnQ9R207 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NbnQ9R207 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NbnQ9R207 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NbnQ9R207 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NbnQ9R207 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NbnQ9R207 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NbnQ9R207 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NbnQ9R207 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NbnQ9R207 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms