Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Psma1Q9R1P4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Psma1Q9R1P4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Psma1Q9R1P4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Psma1Q9R1P4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Psma1Q9R1P4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Psma1Q9R1P4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Psma1Q9R1P4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Psma1Q9R1P4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psma1Q9R1P4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psma1Q9R1P4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psma1Q9R1P4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psma1Q9R1P4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psma1Q9R1P4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psma1Q9R1P4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psma1Q9R1P4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psma1Q9R1P4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psma1Q9R1P4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psma1Q9R1P4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psma1Q9R1P4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psma1Q9R1P4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psma1Q9R1P4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psma1Q9R1P4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psma1Q9R1P4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psma1Q9R1P4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psma1Q9R1P4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Psma1Q9R1P4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psma1Q9R1P4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psma1Q9R1P4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psma1Q9R1P4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psma1Q9R1P4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psma1Q9R1P4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psma1Q9R1P4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psma1Q9R1P4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psma1Q9R1P4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psma1Q9R1P4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psma1Q9R1P4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psma1Q9R1P4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psma1Q9R1P4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psma1Q9R1P4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psma1Q9R1P4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psma1Q9R1P4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psma1Q9R1P4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psma1Q9R1P4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psma1Q9R1P4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psma1Q9R1P4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psma1Q9R1P4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psma1Q9R1P4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Psma1Q9R1P4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psma1Q9R1P4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Psma1Q9R1P4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psma1Q9R1P4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psma1Q9R1P4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psma1Q9R1P4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psma1Q9R1P4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psma1Q9R1P4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Psma1Q9R1P4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Psma1Q9R1P4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psma1Q9R1P4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psma1Q9R1P4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psma1Q9R1P4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psma1Q9R1P4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psma1Q9R1P4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psma1Q9R1P4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psma1Q9R1P4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psma1Q9R1P4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psma1Q9R1P4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psma1Q9R1P4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psma1Q9R1P4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psma1Q9R1P4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psma1Q9R1P4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psma1Q9R1P4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psma1Q9R1P4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psma1Q9R1P4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psma1Q9R1P4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psma1Q9R1P4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psma1Q9R1P4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psma1Q9R1P4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psma1Q9R1P4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Psma1Q9R1P4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psma1Q9R1P4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psma1Q9R1P4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Psma1Q9R1P4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psma1Q9R1P4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psma1Q9R1P4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psma1Q9R1P4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psma1Q9R1P4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psma1Q9R1P4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psma1Q9R1P4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Psma1Q9R1P4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Psma1Q9R1P4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Psma1Q9R1P4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Psma1Q9R1P4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psma1Q9R1P4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psma1Q9R1P4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psma1Q9R1P4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psma1Q9R1P4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psma1Q9R1P4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psma1Q9R1P4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psma1Q9R1P4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms